Marmaray, Sirkeci istasyonunda durmuyor. İstasyonda devam eden turnike, yürüyen merdiven ve dış cephe çalışmaları nedeniyle tramvaylar, her iki istikamette de Sirkeci İstasyonunda durmuyor.

Yenikapı'dan Marmaray'a binen yolcular, Sirkeci'de inemediği için Üsküdar'a kadar gitmek zorunda kalıyor. Karşı yönden gelen yolcular ise Yenikapı'da iniyor.