Aziz Nikolai Kilisesi (Almanca: St.-Nikolai-Kirche), Almanya'nın Hamburg kentinde bulunan eskiden ana beş Lüterci kiliseden biri olan kilisedir. Yapımı 1846'dan 1874'e kadar sürmüştür. İkinci Dünya Savaşı'da Müttefik Devletler'in hava saldırıları sonucunda büyük zarar görmüştür. Günümüzde yıkı halinde olan kilise, anıt görevi görmektedir. İkinci Dünya Savaşı'ndan sonra Harvestehude'ye yeni bir Aziz Nikolai Kilisesi yapılmıştır.
Kilise 1874'ten 1876'ya kadar Dünya'nın en yüksek yapısı ünvanına sahip olmuştur. Şu anda Hamburg'un en yüksek ikinci yapısıdır. Günümüzde Hamburglular "Nikolaikirche" dendiğinde hâlâ eski kiliseyi anlamaktadırlar.
